IMAP behandelt gelesene und ungelesene Nachrichten anders. Ungelesene Nachrichten werden als solche markiert und fett angezeigt. Wenn der Benutzer eine ungelesene Nachricht öffnet, wird sie als gelesen markiert und das fette Format wird entfernt. Die Markierung kann auch manuell geändert werden, indem der Benutzer eine Nachricht als “ungelesen” markiert oder eine gelesene Nachricht als “ungelesen” markiert. Diese Informationen werden auf dem Server gespeichert, so dass sie auf allen Geräten synchronisiert werden, die auf dasselbe IMAP-Konto zugreifen.
