SFTP-Dateien werden durch eine sichere Übertragung über das Secure Shell (SSH) Protokoll geschützt. Dies bedeutet, dass alle Daten verschlüsselt werden, während sie über das Netzwerk übertragen werden. Zusätzlich können bestimmte Sicherheitsmaßnahmen wie VPN, Firewall und Zwei-Faktor-Authentifizierung eingesetzt werden, um zusätzliche Schutzschichten für die SFTP-Dateien und das Netzwerk bereitzustellen. Außerdem können die Dateien mit Verschlüsselungsalgorithmen wie AES oder RSA verschlüsselt werden, um sicherzustellen, dass sie vor unbefugtem Zugriff geschützt sind, wenn sie auf dem Server gespeichert werden.