Eine SNMPv3-PDU kann mit einem Verschlüsselungsmechanismus verschlüsselt werden, der auf dem AES-Algorithmus (Advanced Encryption Standard) basiert. Dazu wird der Datenschlüssel aus dem Authentifizierungsprotokoll verwendet. Die Verschlüsselung erfolgt innerhalb des Payload-Bereichs der SNMPv3-Nachricht. Die verschlüsselte PDU wird dann über das Netzwerk übertragen. Am Empfängercomputer wird die PDU entschlüsselt und entschlüsselt. Der empfangende Computer muss den passenden Datenschlüssel haben, um die verschlüsselte PDU erfolgreich zu entschlüsseln.