IPv6 cuenta con soporte nativo para todos los protocolos de capa superior que existen actualmente en IPv4, como TCP, UDP, ICMP y OSPF. Además, también se pueden soportar nuevos protocolos de capa superior, gracias a la mayor capacidad del número de address de IPv6.
Esto significa que, en principio, cualquier protocolo de capa superior que funcione en IPv4 puede funcionar también en IPv6, a menos que haya sido diseñado específicamente para trabajar sólo con IPv4. En cualquier caso, la mayoría de los protocolos ya han sido adaptados y actualizados para funcionar con IPv6.
Sólo se necesita por tanto, una función de traducción o adaptación de protocolos que permita que los dispositivos que utilizan diferentes versiones de los protocolos puedan comunicarse correctamente. Por otro lado, es importante destacar que los protocolos de capa de transporte, como TCP y UDP, no cambian con IPv6, lo que significa que se utilizan las mismas funciones y procedimientos para garantizar la calidad de la transmisión.
