Los paquetes TFTP se numeran automáticamente en secuencia, comenzando desde 0 y aumentando en 1 con cada paquete enviado. Estos números de secuencia son utilizados para confirmar la recepción y el envío correcto de los paquetes. Cuando un paquete es recibido por el receptor, este envía un mensaje de confirmación de recepción (ACK) al emisor, indicando que recibió correctamente el paquete. Si el emisor no recibe un ACK dentro de un tiempo determinado, reenviará el paquete con el mismo número de secuencia.