Le quote di trasferimento file FTP possono essere controllate attraverso le impostazioni del software FTP utilizzato per la connessione. In genere, questi software includono opzioni per limitare la velocità di upload e download, il numero di connessioni simultanee, e il tempo massimo per la trasmissione di ogni file. In alcuni casi, le quote possono essere impostate anche a livello di server FTP, attraverso il pannello di amministrazione fornito dal provider di hosting. In ogni caso, per controllare le quota di trasferimento file FTP è consigliabile consultare la documentazione del software utilizzato e/o chiedere assistenza al provider di hosting.