FTP non utilizza la crittografia per proteggere le informazioni trasmesse tra il client e il server. Tutte le informazioni, tra cui username e password, vengono trasmesse in chiaro e possono essere facilmente intercettate e visualizzate da terze parti. Tuttavia, esistono versioni sicure di FTP, come SFTP (FTP sicuro) e FTPS (FTP sicuro con SSL/TLS), che utilizzano la crittografia per proteggere le informazioni trasmesse.
