BGP-routeringsconflicten worden opgelost door de voorgestelde routes in BGP te vergelijken en te bepalen welke routering het meest geschikt is voor het bereiken van een bepaalde bestemming. Deze evaluatie omvat factoren zoals het aantal hops, de snelheid van de verbindingen en de kosten. Als er meerdere routes beschikbaar zijn, zal het BGP-protocol de beste route kiezen op basis van de criteria die door de administrator zijn opgegeven in de BGP-configuratie. Als er echter conflicten zijn tussen routes, kan het nodig zijn om handmatig in te grijpen en de BGP-configuratie aan te passen om de conflicten op te lossen.